Kanker nasofaring dikenal dengan nama karsinoma nasofaring. Udara dikirim dari lubang hidung ke trakea, atau tenggorokan, melalui struktur yang terletak di belakang rongga hidung. Ketika sel dalam struktur ini bermutasi dan mulai berkembang biak dengan cepat, kanker nasofaring berkembang.
Sebagian besar keganasan nasofaring berasal dari bagian belakang hidung. Sebagian besar kasus kanker orofaring adalah karsinoma sel skuamosa karena lapisannya terdiri dari sel-sel tipis dan datar yang disebut sel skuamosa.